CellNetVis: a web tool for visualization of biological networks using force-directed layout constrained by cellular components

An Improvement of Force-directed Hierarchical Graph Layout And Its Application to Web Site Visualization

グラフデータの視覚化技術は,近年活発に研究が進められており,金融・交通・通信・社会組織・科学・計算機システム・ インターネットなど,非常に幅広い分野のデータ分析およびデータ監視の目的での実用が報告されている.グラフデータの視 覚化における最も大きな問題は,「グラフを誤読させない適切なノードの画面配置を,自動的に実現する」という問題である. この問題を解決するために,ノードに分子間力モデル,アークにバネモデルを適用して,運動方程式によって良質なノード配 置結果を得る手法が提案されている. 本論文では,上記のような「力学モデルを用いたグラフデータの画面配置手法」の改良手法および階層型グラフデータへの 拡張手法を提案する.本手法は,ノードを1個ずつ配置するインクリメンタルなアルゴリズムにより,配置結果を改善すると ともに,計算時間の増加を抑えることに成功している. また本論文では,上記手法...

Three Dimensional UML Using Force Directed Layout

Force Directed Layout of Diagrams

.............................................................................................................3 Acknowledgements ............................................................................................4 Table of

eulerForce: Force-directed Layout for Euler Diagrams

Euler diagrams use closed curves to represent sets and their relationships. They facilitate set analysis, as humans tend to perceive distinct regions when closed curves are drawn on a plane. However, current automatic methods often produce diagrams with irregular, nonsmooth curves that are not easily distinguishable. Other methods restrict the shape of the curve to for instance a circle, but su...

Force - Directed Layout for Euler Diagrams Luana

Euler diagrams are the only diagrams that intuitively represent containment, intersection and exclusion of data, but none of the current automatic diagram layout techniques produce good layouts in a reasonable time. We adopt a force-directed approach to automatically layout aesthetically pleasing Euler diagrams in a relatively fast time. A Java prototype demonstrates our novel force model.